More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1742 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 617 aa  1286    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.81 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.88 
 
 		 450 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.18 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.24 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.24 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.24 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.94 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4728  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.91 
 
 		 628 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.43 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.86 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.2 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.58 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.37 
 
 		 606 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.51 
 
 		 567 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.16 
 
 		 457 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.11 
 
 		 917 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.37 
 
 		 468 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.06 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.86 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1931  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.16 
 
 		 628 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.38 
 
 		 453 aa  498  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.86 
 
 		 463 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.41 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1891  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.92 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0976553  normal  0.536126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  54 
 
 		 647 aa  495  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.67 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.49 
 
 		 638 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.54 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0569  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.83 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000923464  decreased coverage  0.00000172451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.92 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0307755  normal  0.0806317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.38 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3206  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.2 
 
 		 627 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  57.24 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3175  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.81 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.84 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.07 
 
 		 586 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.97 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.83 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.19 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.51 
 
 		 652 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.21 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4530  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.22 
 
 		 627 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391297  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.63 
 
 		 666 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2054  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.29 
 
 		 608 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1629  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.65 
 
 		 630 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984407  normal  0.732533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.51 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.6 
 
 		 654 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.75 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3185  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.9 
 
 		 628 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0350436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.17 
 
 		 607 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.91 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.81 
 
 		 586 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.2 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.97 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.58 
 
 		 617 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.91 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.81 
 
 		 586 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.6 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.63 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.38 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2561  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.01 
 
 		 608 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4096  thiamine biosynthesis protein ThiC  53 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.54 
 
 		 606 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0892  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 885 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.3 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.65 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.87 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.71 
 
 		 585 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.46 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.03 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2430  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 628 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.04 
 
 		 629 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.95 
 
 		 622 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.4 
 
 		 627 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.06 
 
 		 628 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1954  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.24 
 
 		 646 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3432  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.45 
 
 		 641 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0959  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.15 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.58 
 
 		 628 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.05 
 
 		 475 aa  485  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6395  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.01 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0500237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.4 
 
 		 627 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.09 
 
 		 626 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2999  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.23 
 
 		 609 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2944  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.48 
 
 		 599 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.858401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.82 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.82 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>