More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2890 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 432 aa  885    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.06 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.36 
 
 		 434 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.36 
 
 		 432 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.04 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.2 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.96 
 
 		 431 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.81 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  62.73 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.8 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  62 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.56 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.68 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.31 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.45 
 
 		 435 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.8 
 
 		 432 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.23 
 
 		 430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.16 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.4 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.33 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.51 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.27 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.27 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.04 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.78 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.4 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.27 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.28 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.69 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.33 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.68 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.46 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.33 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.82 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.76 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.23 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.95 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.77 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.77 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.14 
 
 		 431 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.71 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.25 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.24 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.47 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.39 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.53 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.07 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.24 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.53 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.07 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.07 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.8 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.23 
 
 		 457 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.68 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.21 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.66 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.29 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.82 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.18 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.34 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.53 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.4 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.07 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.83 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.62 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.85 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.82 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.08 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.29 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.83 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.18 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 		 463 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.41 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.05 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.34 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.41 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.2 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.59 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.46 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>