More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2776 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 429 aa  887    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.42 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.61 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.16 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.46 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.61 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.61 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.37 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.61 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.49 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.31 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.19 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.31 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.52 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.03 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.73 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.43 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.02 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.53 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.19 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.86 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  51.29 
 
 		 431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.37 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.4 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.05 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.65 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.72 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.96 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.96 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.48 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.56 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.66 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.8 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.26 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.12 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.37 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.36 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.37 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.54 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.82 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.89 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.95 
 
 		 652 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.71 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.78 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.52 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  46.42 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.7 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  47 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.7 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.7 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.54 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.52 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.04 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.52 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38085  predicted protein  45.37 
 
 		 619 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.73 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.04 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.44 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.81 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.67 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0446  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.32 
 
 		 611 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 		 917 aa  365  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.34 
 
 		 457 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.19 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.01 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.06 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 		 457 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.71 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 		 568 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.28 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0958  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.34 
 
 		 618 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.07 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.28 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 		 561 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.28 
 
 		 466 aa  362  6e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.01 
 
 		 607 aa  362  9e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.34 
 
 		 547 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.48 
 
 		 503 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.01 
 
 		 585 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.34 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>