More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2236 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  78.37 
 
 		 436 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  78.64 
 
 		 429 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 430 aa  885    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  78.55 
 
 		 436 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  76.05 
 
 		 437 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  75.81 
 
 		 437 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  75.52 
 
 		 435 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.19 
 
 		 432 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.12 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.99 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.71 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  57.88 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.88 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.35 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.71 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.39 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.12 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.59 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.85 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.12 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.29 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.83 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.68 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.12 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.16 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.53 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.1 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.66 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.42 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.14 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.07 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.06 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.46 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.47 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 		 473 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.99 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.24 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.29 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.57 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.74 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.98 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.81 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.81 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.29 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.9 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.27 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.76 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.65 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.46 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.1 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.16 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.28 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.73 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.57 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.41 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.86 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.78 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.86 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.54 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.02 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.29 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.86 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.34 
 
 		 457 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.33 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 463 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.22 
 
 		 617 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.73 
 
 		 562 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.82 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 573 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.06 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.06 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.35 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.06 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.64 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.35 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>