More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1595 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.25 
 
 
426 aa  708    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.41 
 
 
424 aa  732    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  84 
 
 
424 aa  763    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
425 aa  878    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.76 
 
 
425 aa  731    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.12 
 
 
427 aa  616  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.08 
 
 
428 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.84 
 
 
427 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.24 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.24 
 
 
435 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  56 
 
 
435 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.92 
 
 
435 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.92 
 
 
435 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.74 
 
 
435 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 
436 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.71 
 
 
432 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.27 
 
 
432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.7 
 
 
432 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 
426 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.81 
 
 
426 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 
426 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 
426 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.29 
 
 
426 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.94 
 
 
435 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 
437 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.34 
 
 
429 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 
431 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
431 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 
437 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.86 
 
 
429 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.01 
 
 
428 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 
436 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  49.65 
 
 
431 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
436 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.82 
 
 
434 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.23 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.1 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.24 
 
 
432 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.83 
 
 
426 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.23 
 
 
442 aa  397  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.09 
 
 
426 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 
436 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.5 
 
 
436 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  45 
 
 
431 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 
424 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
426 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 
424 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
433 aa  375  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.6 
 
 
425 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
436 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
436 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.36 
 
 
431 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.65 
 
 
428 aa  364  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.92 
 
 
432 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.08 
 
 
426 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.93 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.82 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.45 
 
 
432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 
453 aa  362  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.43 
 
 
425 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.41 
 
 
432 aa  359  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.23 
 
 
426 aa  358  9e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 
453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.99 
 
 
433 aa  355  5.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.96 
 
 
425 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
459 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
460 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
460 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.53 
 
 
458 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.43 
 
 
421 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 
456 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.65 
 
 
456 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 
456 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 
457 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.23 
 
 
456 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  42 
 
 
430 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.24 
 
 
430 aa  346  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.14 
 
 
450 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42 
 
 
430 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.48 
 
 
457 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 
459 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.99 
 
 
466 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.38 
 
 
460 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.39 
 
 
459 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.5 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 
484 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 
468 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.45 
 
 
420 aa  338  8e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.97 
 
 
436 aa  338  9e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.11 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  42 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.99 
 
 
456 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>