More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0416 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 432 aa  876    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.64 
 
 		 426 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.12 
 
 		 425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.55 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.77 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.48 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.05 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.15 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.82 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.39 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.66 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.42 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.24 
 
 		 426 aa  360  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.85 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.18 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.97 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.38 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.1 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.3 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.32 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  46.14 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.3 
 
 		 425 aa  339  7e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.98 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.06 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.97 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.59 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.59 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.71 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.89 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.04 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.06 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.04 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.69 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.25 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.48 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.19 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.76 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.02 
 
 		 432 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.36 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.55 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.65 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.75 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.72 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.39 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.86 
 
 		 473 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  40 
 
 		 431 aa  318  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.37 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.47 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.72 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.88 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.86 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.8 
 
 		 420 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.38 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.52 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.41 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 456 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.78 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.93 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.66 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.2 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.96 
 
 		 489 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.43 
 
 		 466 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.23 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.73 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.39 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.51 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.06 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.96 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.91 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.12 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.15 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.38 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.09 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.31 
 
 		 432 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.09 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.09 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>