More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0053 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 426 aa  850    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.64 
 
 		 432 aa  645    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.29 
 
 		 425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.06 
 
 		 424 aa  558  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.35 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.44 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.34 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.76 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.28 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.72 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.9 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.48 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.9 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.76 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.23 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.26 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  48 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.21 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.74 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.78 
 
 		 431 aa  355  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.54 
 
 		 436 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.83 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.81 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.07 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  47.26 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 435 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.57 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.17 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.51 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.75 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.37 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.37 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.79 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.24 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.53 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.83 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.02 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.99 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.24 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.24 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.53 
 
 		 434 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.85 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.05 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.49 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.34 
 
 		 481 aa  332  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.56 
 
 		 456 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.39 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.2 
 
 		 473 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.07 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.28 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.57 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.32 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.32 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.41 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.02 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.55 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.58 
 
 		 437 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  45 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.47 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.32 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.9 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.11 
 
 		 617 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.34 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.37 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.54 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.48 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.01 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.33 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.96 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.96 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 484 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.73 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.5 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.37 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.34 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>