More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1977 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.29 
 
 		 426 aa  678    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.41 
 
 		 425 aa  732    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.67 
 
 		 424 aa  773    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  77.88 
 
 		 425 aa  710    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 424 aa  877    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.35 
 
 		 427 aa  628  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.61 
 
 		 428 aa  607  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.76 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.06 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  56 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.76 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.98 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.5 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.98 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.18 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.18 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.1 
 
 		 426 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.65 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.86 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  49.88 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.86 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.62 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.9 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.82 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.7 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.87 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.34 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.48 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.28 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.79 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.77 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.57 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.76 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.48 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.13 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.13 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.17 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.98 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.57 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 		 453 aa  355  5.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 		 432 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.24 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.89 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.19 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.87 
 
 		 466 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.41 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.41 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.12 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.05 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.75 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.39 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.45 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.5 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.5 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 		 457 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.47 
 
 		 459 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.68 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.94 
 
 		 484 aa  343  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.09 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.48 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.57 
 
 		 456 aa  338  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  42 
 
 		 473 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.38 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.4 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.92 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.57 
 
 		 441 aa  333  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.16 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.14 
 
 		 450 aa  333  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.36 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.47 
 
 		 481 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.81 
 
 		 489 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>