More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0200 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
421 aa  860    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.55 
 
 
432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.14 
 
 
425 aa  551  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.35 
 
 
426 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.94 
 
 
424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.83 
 
 
428 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.39 
 
 
429 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.88 
 
 
426 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.38 
 
 
426 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.39 
 
 
426 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.65 
 
 
426 aa  375  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.28 
 
 
426 aa  373  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.9 
 
 
428 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.43 
 
 
425 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 
424 aa  362  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.83 
 
 
424 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.24 
 
 
427 aa  358  7e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.68 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.38 
 
 
431 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.64 
 
 
431 aa  353  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.81 
 
 
436 aa  352  8.999999999999999e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.71 
 
 
424 aa  350  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
435 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  48.15 
 
 
431 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.91 
 
 
425 aa  347  3e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.99 
 
 
425 aa  346  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.85 
 
 
432 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 
436 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
436 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.34 
 
 
427 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.15 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.34 
 
 
436 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.87 
 
 
435 aa  340  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.22 
 
 
481 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.25 
 
 
426 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.47 
 
 
468 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.34 
 
 
432 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.8 
 
 
432 aa  338  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.53 
 
 
432 aa  334  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.75 
 
 
453 aa  332  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.31 
 
 
437 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.12 
 
 
432 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 
435 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 
435 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 
430 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.77 
 
 
460 aa  329  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 
489 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.52 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 
463 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.33 
 
 
435 aa  325  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.33 
 
 
435 aa  326  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.24 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.99 
 
 
475 aa  323  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.52 
 
 
434 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 
442 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.33 
 
 
428 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.78 
 
 
425 aa  323  5e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 
450 aa  323  5e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
426 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.93 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.93 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.64 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.52 
 
 
429 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.42 
 
 
453 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.22 
 
 
426 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.55 
 
 
432 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 
436 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.5 
 
 
436 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.68 
 
 
459 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.26 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 
503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.17 
 
 
568 aa  312  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.54 
 
 
431 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 
547 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.42 
 
 
573 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
573 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
562 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.56 
 
 
432 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 
429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.69 
 
 
458 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.87 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.14 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.19 
 
 
617 aa  306  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.69 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.67 
 
 
456 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
586 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
429 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
586 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.3 
 
 
586 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0446  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>