More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1592 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 425 aa  862    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.48 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.59 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.36 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.26 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  46.82 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.59 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.35 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.82 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.59 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.6 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.69 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.33 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.52 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.12 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.16 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.22 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.24 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.28 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.47 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.69 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.1 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.36 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.98 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.52 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.16 
 
 		 435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.96 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.43 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.96 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.47 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.15 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.36 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 		 453 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.05 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.3 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.06 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.66 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.53 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.09 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.84 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 		 481 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.69 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.29 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.21 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.33 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.82 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.69 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.85 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.91 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.47 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.23 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.66 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.47 
 
 		 457 aa  335  9e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.43 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.43 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.66 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.95 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.22 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.75 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.76 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.52 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.78 
 
 		 426 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.52 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.36 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.72 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.42 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.77 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.92 
 
 		 617 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.15 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>