More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1991 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
436 aa  904    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.9 
 
 
436 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.44 
 
 
436 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.3 
 
 
441 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.59 
 
 
433 aa  595  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.07 
 
 
432 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.98 
 
 
431 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.91 
 
 
430 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.6 
 
 
430 aa  584  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.65 
 
 
431 aa  587  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.83 
 
 
430 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.44 
 
 
424 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.4 
 
 
420 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.65 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.47 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.21 
 
 
432 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.77 
 
 
432 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.2 
 
 
426 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.96 
 
 
426 aa  431  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
437 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.54 
 
 
435 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 
468 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
453 aa  425  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.62 
 
 
453 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.96 
 
 
426 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.96 
 
 
426 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.65 
 
 
437 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 
460 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 
460 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.95 
 
 
436 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 
460 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 
459 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.43 
 
 
450 aa  419  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.48 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.86 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.96 
 
 
431 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 
459 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.87 
 
 
457 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.82 
 
 
431 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.25 
 
 
449 aa  413  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.46 
 
 
466 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.94 
 
 
484 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.87 
 
 
457 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.46 
 
 
456 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 
458 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.04 
 
 
426 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.99 
 
 
426 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 
424 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.24 
 
 
434 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  50.35 
 
 
431 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.45 
 
 
425 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.23 
 
 
459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.56 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.05 
 
 
481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.99 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.99 
 
 
466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
431 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
432 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.51 
 
 
480 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 
456 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
503 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.03 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.3 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 
606 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.35 
 
 
530 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.41 
 
 
617 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.48 
 
 
428 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.46 
 
 
430 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.54 
 
 
436 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.35 
 
 
432 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.48 
 
 
429 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.31 
 
 
573 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.49 
 
 
562 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
530 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.54 
 
 
417 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.77 
 
 
567 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  45.65 
 
 
554 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.9 
 
 
652 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.08 
 
 
573 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
561 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
548 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.74 
 
 
647 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.66 
 
 
631 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.91 
 
 
475 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.88 
 
 
605 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.35 
 
 
587 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
586 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.88 
 
 
607 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.88 
 
 
635 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
586 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>