More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1173 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.41 
 
 
424 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.7 
 
 
426 aa  645    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
427 aa  869    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.35 
 
 
424 aa  628  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.76 
 
 
428 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.12 
 
 
425 aa  616  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.31 
 
 
425 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.59 
 
 
427 aa  595  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.14 
 
 
435 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.42 
 
 
435 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.99 
 
 
435 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
435 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.75 
 
 
435 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.99 
 
 
435 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.55 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.27 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.05 
 
 
428 aa  448  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.25 
 
 
435 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.54 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.03 
 
 
432 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.67 
 
 
437 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.72 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.64 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 
436 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.2 
 
 
437 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 
426 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.45 
 
 
429 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 
426 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.28 
 
 
431 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 
431 aa  431  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 
426 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.17 
 
 
426 aa  428  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.27 
 
 
434 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
425 aa  427  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.08 
 
 
432 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  50.58 
 
 
431 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.28 
 
 
432 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.34 
 
 
435 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.39 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.85 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.06 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.68 
 
 
432 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.67 
 
 
433 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 
424 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 
424 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 
436 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.04 
 
 
431 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 
436 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 
426 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 
442 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.34 
 
 
453 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.71 
 
 
426 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.42 
 
 
425 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.24 
 
 
432 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.5 
 
 
425 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
436 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
436 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.28 
 
 
426 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.29 
 
 
456 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.76 
 
 
456 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.12 
 
 
428 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 
456 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 
460 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.32 
 
 
453 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 
456 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 
460 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 
466 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.69 
 
 
481 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
459 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 
473 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 
466 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 
432 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.29 
 
 
458 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.19 
 
 
459 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.34 
 
 
424 aa  358  9e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.35 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.85 
 
 
432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.57 
 
 
457 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 
457 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.71 
 
 
443 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 
460 aa  354  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.28 
 
 
450 aa  354  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.5 
 
 
468 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 
456 aa  352  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.7 
 
 
486 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 
484 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.36 
 
 
431 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 
466 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.88 
 
 
430 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.76 
 
 
449 aa  346  4e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.24 
 
 
421 aa  345  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.65 
 
 
430 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.17 
 
 
430 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.21 
 
 
475 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.37 
 
 
617 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 
489 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>