More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1068 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1068  ABC transporter related  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2222  ABC transporter related protein  63.99 
 
 		 286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0826  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.07 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  36.27 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.18 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.01 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.91 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.53 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  40 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.45 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  34.01 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.59 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0105  ABC transporter  37.91 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.252564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.5 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf140  ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.013687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.35 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  36.62 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  36.67 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.29 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  36.65 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  32.04 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.78 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.7 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.52 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  40.49 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.32 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.36 
 
 		 741 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.15 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  40.5 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.16 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  36.79 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.94 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.7 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.07 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  36.02 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  36.76 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  36.4 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.84 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  33.68 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  38.5 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  32.62 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.32 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  35.94 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.77 
 
 		 337 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.05 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.51 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  35.47 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  33.49 
 
 		 339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  36.62 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  32.75 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.35 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  32.98 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.47 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  29.63 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.22 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  31.78 
 
 		 247 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  35.29 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.53 
 
 		 236 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  36.15 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  38.36 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.51 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.56 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  32.28 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  33.62 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  34.25 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.67 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.47 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  34.13 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.94 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  34.21 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  38.05 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  38.32 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  33.65 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>