More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1303 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1303  LigA  100 
 
 		 365 aa  743    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.082327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0394  hypothetical protein  87.12 
 
 		 375 aa  664    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  57.71 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.19 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  48.48 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  48.3 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.2 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.76 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.07 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.17 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.09 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 366 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44.16 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.41 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.71 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.92 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.87 
 
 		 364 aa  305  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  45.53 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.63 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  43.75 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  42.45 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  44.07 
 
 		 367 aa  298  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  43.4 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  44.03 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  40.96 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  44.76 
 
 		 367 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  43.53 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  44.94 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  45.64 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  44.1 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  43.91 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  44.19 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  45.14 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  44.48 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.53 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  45.24 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.58 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 417 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  49.85 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 		 374 aa  292  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  43.18 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.1 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  41.53 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.1 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  42.9 
 
 		 375 aa  290  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  43.75 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 378 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  45.5 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.66 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  40.5 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  47.68 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  42.25 
 
 		 367 aa  288  8e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.41 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  45.6 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 		 365 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.89 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.69 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.75 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  45.91 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  42.39 
 
 		 376 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  42.9 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  43.99 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  44.64 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  42.61 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  44.04 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  45.16 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  43.4 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 317 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>