More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0394 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1303  LigA  87.12 
 
 		 365 aa  664    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.082327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0394  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  770    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  56 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.31 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.9 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  45.68 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.58 
 
 		 383 aa  315  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.7 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  46.74 
 
 		 367 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  46.74 
 
 		 367 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.97 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 362 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  46.46 
 
 		 367 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.08 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  44.16 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  45.89 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.22 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  46.33 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.31 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 337 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  45.76 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 391 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.2 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  46.43 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  44.94 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  45.16 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.46 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  45.04 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.2 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.51 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  45.04 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.86 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.17 
 
 		 365 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  44.76 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 325 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  45.04 
 
 		 367 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.78 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  45.04 
 
 		 367 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  41.91 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  41.81 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.38 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.32 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  44.94 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  42.21 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  44.66 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.37 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  47.4 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 357 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  43.06 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  42.18 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.61 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4162  peptide chain release factor 2  50.32 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  46.53 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  41.6 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  42.5 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  44.01 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  42.35 
 
 		 349 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  43.7 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 371 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 371 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  45.11 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.21 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.17 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  46.82 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  42.35 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  43.18 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  42.06 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  42.9 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.89 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  48.93 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>