More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0910 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0910  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 474 aa  992    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3393  putative aminotransferase  43.75 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.78 
 
 		 479 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 470 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.52 
 
 		 470 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 477 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 477 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  31.74 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 496 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 496 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.43 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.97 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 482 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.19 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.67 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.45 
 
 		 474 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 496 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 502 aa  246  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 509 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.31 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.47 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  33.33 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.1 
 
 		 487 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  31.43 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.94 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 475 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  31.67 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.44 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.63 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.57 
 
 		 471 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 491 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.71 
 
 		 472 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  31.21 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.66 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.22 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 494 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 476 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 491 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 471 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  29.75 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  31.04 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 481 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  31.4 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.4 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  31.4 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  30.62 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>