More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3393 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3393  putative aminotransferase  100 
 
 		 500 aa  1048    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0910  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.19 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 471 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 487 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.34 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 477 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.87 
 
 		 471 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 477 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.49 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  32.05 
 
 		 500 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.29 
 
 		 479 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 491 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 469 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  30.63 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  30.83 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.83 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  30.83 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 469 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 494 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.43 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  30.58 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.51 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.86 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.86 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.58 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.86 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.9 
 
 		 483 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  31.83 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.57 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.63 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  30.53 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 489 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.09 
 
 		 472 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.69 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.44 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  29.84 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  30 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.44 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  33.76 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  32.26 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  29.56 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.81 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 478 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 470 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.13 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>