More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0447 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  66.67 
 
 
216 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.74 
 
 
218 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.12 
 
 
217 aa  297  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  66.98 
 
 
217 aa  296  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  66.98 
 
 
217 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.98 
 
 
217 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.35 
 
 
218 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.74 
 
 
218 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.28 
 
 
218 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.19 
 
 
216 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  60 
 
 
216 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.41 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.41 
 
 
218 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.57 
 
 
217 aa  271  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 
215 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.87 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
215 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.8 
 
 
219 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.94 
 
 
215 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.35 
 
 
218 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.8 
 
 
219 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.48 
 
 
216 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  57.87 
 
 
216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  55.81 
 
 
219 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.17 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  54.17 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.17 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.35 
 
 
217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.35 
 
 
217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  57.48 
 
 
215 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  50.93 
 
 
218 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.29 
 
 
215 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.84 
 
 
217 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.51 
 
 
217 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  57.35 
 
 
212 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  54.74 
 
 
217 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  56.4 
 
 
214 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3334  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52 
 
 
217 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.74 
 
 
218 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4511  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.7 
 
 
216 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0761922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.18 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5080  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 
218 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  46.38 
 
 
214 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
214 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1743  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
216 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 
213 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
219 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.02 
 
 
217 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 
219 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3418  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 
217 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.68 
 
 
217 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 
214 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.64 
 
 
214 aa  187  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
216 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  40.89 
 
 
216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  36.57 
 
 
219 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 
214 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.98 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.83 
 
 
222 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
222 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
228 aa  138  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
503 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
234 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
503 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.27 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  38.27 
 
 
223 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
222 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  37.04 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  36.19 
 
 
502 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
221 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0693  amino acid ABC transporter permease  36.24 
 
 
229 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  41.36 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  35.71 
 
 
502 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0211  amino acid ABC transporter, permease  36.04 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  36.46 
 
 
235 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  36.46 
 
 
235 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.26 
 
 
221 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  36.46 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  36.46 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  34.54 
 
 
489 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 
489 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 
489 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
209 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
209 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.25 
 
 
216 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
232 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>