More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6713 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.15 
 
 
218 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  76.15 
 
 
218 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  77.52 
 
 
218 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.04 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  62.04 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.04 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.09 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.77 
 
 
216 aa  254  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.57 
 
 
219 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  62.04 
 
 
216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.19 
 
 
219 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.6 
 
 
217 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.93 
 
 
216 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  56.94 
 
 
216 aa  248  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  55.81 
 
 
216 aa  247  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  58.6 
 
 
219 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.33 
 
 
219 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.05 
 
 
218 aa  245  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  56.07 
 
 
215 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.84 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3334  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.38 
 
 
217 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.34 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.82 
 
 
215 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.66 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.19 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  55.19 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.59 
 
 
218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  55.92 
 
 
212 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  54.72 
 
 
217 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.63 
 
 
218 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  55.45 
 
 
214 aa  227  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  55.61 
 
 
215 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.13 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.76 
 
 
217 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.76 
 
 
217 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 
218 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.07 
 
 
213 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.61 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.78 
 
 
217 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  50.26 
 
 
217 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  47.03 
 
 
214 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.26 
 
 
217 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.04 
 
 
222 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5080  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
218 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.58 
 
 
214 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4511  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 
216 aa  201  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0761922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3418  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
217 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
217 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.53 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.51 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
219 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1743  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.51 
 
 
216 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
214 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  45.32 
 
 
216 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  42.4 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.12 
 
 
216 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.81 
 
 
217 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
222 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.16 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  40.2 
 
 
223 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  40.2 
 
 
222 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  37.98 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
219 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
219 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
219 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 
219 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 
230 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
230 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  38.19 
 
 
219 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
274 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
232 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
219 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 
221 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 
215 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  41.44 
 
 
234 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1528  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
230 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4694  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
230 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586539  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 
232 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1552  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
230 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0758513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  36.98 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  37.5 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  37.5 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  36.98 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.42 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0717  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
215 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>