More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3467 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  98.62 
 
 
218 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  88.94 
 
 
217 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  88.94 
 
 
217 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  88.48 
 
 
217 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  89.86 
 
 
218 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  88.02 
 
 
218 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  88.02 
 
 
218 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.12 
 
 
216 aa  297  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  69.05 
 
 
216 aa  293  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.4 
 
 
218 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.4 
 
 
218 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.21 
 
 
216 aa  272  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  62.26 
 
 
216 aa  270  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.44 
 
 
215 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.4 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  63.08 
 
 
219 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.83 
 
 
218 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.26 
 
 
215 aa  261  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.21 
 
 
219 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  61.21 
 
 
215 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.24 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  61.79 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.29 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  54.84 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  61.21 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.71 
 
 
215 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  56.81 
 
 
216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.81 
 
 
216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.81 
 
 
216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  59.52 
 
 
214 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  58.65 
 
 
212 aa  225  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.82 
 
 
217 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.3 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.91 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.5 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.83 
 
 
216 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3334  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.97 
 
 
217 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  51.05 
 
 
217 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4511  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.94 
 
 
216 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0761922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.03 
 
 
219 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1743  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.15 
 
 
216 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.43 
 
 
218 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5080  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3418  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.29 
 
 
213 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
216 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.34 
 
 
213 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  46.63 
 
 
214 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
222 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.76 
 
 
216 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.96 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  45.81 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
217 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
213 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 
214 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  45.12 
 
 
219 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 
216 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
215 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
214 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
503 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  36.36 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 
503 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 
483 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
232 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 
489 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  31.96 
 
 
489 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 
489 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 
222 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  35.41 
 
 
222 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
216 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
219 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  32.84 
 
 
222 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_004310  BR1955  amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
240 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 
222 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  34.93 
 
 
222 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  34.93 
 
 
222 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  34.93 
 
 
222 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3139  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
226 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
226 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2526  amino acid ABC transporter permease  36.71 
 
 
226 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
234 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
232 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  33.85 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  33.85 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  33.85 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  33.85 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>