More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3462 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  74.54 
 
 
216 aa  311  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.61 
 
 
213 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.61 
 
 
213 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.38 
 
 
218 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.07 
 
 
217 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3334  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 
217 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3418  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.28 
 
 
217 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.22 
 
 
216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5080  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.73 
 
 
218 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
216 aa  228  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1743  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.31 
 
 
216 aa  221  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  52.97 
 
 
212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  52.97 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49 
 
 
215 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.76 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 
222 aa  214  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  48.5 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.5 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  49.5 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  48.97 
 
 
216 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.26 
 
 
217 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.27 
 
 
219 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  49.75 
 
 
216 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  47.78 
 
 
219 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
217 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
217 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49 
 
 
219 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
217 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.8 
 
 
219 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
219 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 
218 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.87 
 
 
215 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.73 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.25 
 
 
218 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  50.25 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  50.25 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.49 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.25 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.23 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
216 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.03 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  50 
 
 
215 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  47.24 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.07 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.24 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  47.24 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.24 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.16 
 
 
217 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4511  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.04 
 
 
216 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0761922  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
218 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 
218 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  43.2 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
213 aa  177  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.34 
 
 
217 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  36.32 
 
 
222 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
596 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 
232 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
492 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
234 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.06 
 
 
232 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 
235 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 
235 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.1 
 
 
219 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
493 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  37.95 
 
 
226 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  37.95 
 
 
232 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 
219 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0526601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
228 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0717  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
215 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.09 
 
 
224 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.68 
 
 
221 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  36.95 
 
 
485 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4058  amino acid ABC transporter permease  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3897  amino acid ABC transporter, permease  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.09435e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3904  amino acid ABC transporter, permease  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000728027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4375  amino acid ABC transporter permease  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000115102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0972  amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000627476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4263  amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00620505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
219 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.126592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4224  amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
219 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000683545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4284  amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
219 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000456924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.16 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
483 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  37.31 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.81 
 
 
503 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0780  amino-acid ABC transporter permease protein YckJ  38.24 
 
 
210 aa  139  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  35.75 
 
 
714 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>