More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1510 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.89 
 
 
219 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.15 
 
 
219 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.26 
 
 
215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  62.79 
 
 
216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.93 
 
 
219 aa  277  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.79 
 
 
216 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.72 
 
 
218 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.32 
 
 
215 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.61 
 
 
218 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.61 
 
 
218 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.08 
 
 
217 aa  274  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  63.51 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.91 
 
 
217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  62.91 
 
 
217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.19 
 
 
218 aa  271  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  61.21 
 
 
215 aa  270  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  62.44 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.65 
 
 
216 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  64.65 
 
 
216 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.65 
 
 
216 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  61.14 
 
 
216 aa  266  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.79 
 
 
217 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.72 
 
 
218 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.81 
 
 
216 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.61 
 
 
218 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  58.6 
 
 
218 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.38 
 
 
218 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.6 
 
 
216 aa  257  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0296  amino acid ABC transporter permease  60.75 
 
 
215 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  60.19 
 
 
214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  58.29 
 
 
212 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.82 
 
 
215 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.61 
 
 
217 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.61 
 
 
217 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.85 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.1 
 
 
217 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2105  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  53.61 
 
 
217 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.15 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.68 
 
 
216 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5080  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.07 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3334  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1743  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.2 
 
 
216 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4511  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.29 
 
 
216 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0761922  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 
213 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3418  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.03 
 
 
217 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
219 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.78 
 
 
213 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
217 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.74 
 
 
222 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.5 
 
 
219 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.78 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1600  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  47.76 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  48.28 
 
 
216 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.08 
 
 
214 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.88 
 
 
214 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.49 
 
 
217 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2599  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.5 
 
 
216 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635143  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
213 aa  181  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  44.06 
 
 
219 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 
483 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  36.53 
 
 
237 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
503 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  41 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  37.25 
 
 
223 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
503 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  36.32 
 
 
222 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
216 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
222 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  36.76 
 
 
223 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
216 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
216 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
222 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
489 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  36.79 
 
 
489 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
489 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  36.5 
 
 
218 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  36.5 
 
 
218 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  36.5 
 
 
218 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
218 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  36.63 
 
 
485 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  36 
 
 
218 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  36 
 
 
218 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
218 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 
217 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
221 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218334  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  39.88 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  38.61 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>