163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0701 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.25 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.13 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.11 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  37.34 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  40.43 
 
 		 131 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  33.12 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.74 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  33.54 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.62 
 
 		 178 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.33 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.21 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.24 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.39 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.66 
 
 		 212 aa  84  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.52 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.67 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.22 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  31.76 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.21 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.94 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.88 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  37.34 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.03 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  28.85 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.2 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.58 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.05 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  26.06 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.92 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  31.33 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.92 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  28.77 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.57 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.12 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  30.56 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.41 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.83 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  26.28 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.1 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.97 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  28.07 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  28.87 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.11 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.22 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  27.82 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  26.11 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.76 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  27.81 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.49 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.33 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  26.24 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.95 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.85 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.85 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  25.48 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  25.48 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.67 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  32.03 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  28.57 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.67 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.74 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  29.05 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.61 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.34 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.95 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  29.41 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  30.38 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.41 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.3 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  31.3 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  26.76 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.85 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  27.07 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  29.75 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.75 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0620  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.37 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.595849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.44 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.66 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.95 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  26.92 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  27.45 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.11 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  25.81 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.6 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  27.74 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  28.85 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0336  hypothetical protein  27.85 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>