167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0982 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.3 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.59 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  44.44 
 
 		 166 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.92 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.67 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  41.29 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.26 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.94 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.33 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  42.57 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.23 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.57 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  42.66 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  43.57 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  43.79 
 
 		 160 aa  115  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  40.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.73 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  40.41 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.55 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  38.46 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  37.33 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.85 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.24 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.85 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  38.26 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.56 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  31.54 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.76 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.85 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  39.26 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.28 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.07 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.72 
 
 		 220 aa  92.8  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.6 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  37.76 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  36.11 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  35.21 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.88 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.11 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.84 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.11 
 
 		 204 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.11 
 
 		 245 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.88 
 
 		 253 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  34.53 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 245 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.92 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.39 
 
 		 218 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  30.41 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.75 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  34.65 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  32.68 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  34.03 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  34.68 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.69 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.47 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.48 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.07 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  28.57 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.54 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 263 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.08 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.56 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.94 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.03 
 
 		 271 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.59 
 
 		 217 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.61 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.35 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.16 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.5 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  30.99 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.35 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.41 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.29 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  29.58 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.17 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.25 
 
 		 250 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.38 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.16 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  37.6 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  29.86 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.38 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  29.79 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.81 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>