164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0398 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  64.29 
 
 		 234 aa  217  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  52.12 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.83 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  33.54 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.88 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  42.25 
 
 		 131 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.22 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.94 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  38.41 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.12 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.71 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.68 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.32 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  37.12 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  33.77 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  32.91 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.78 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.78 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.71 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.72 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.57 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.7 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.33 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.06 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  34.51 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.47 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  34.42 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  34.23 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.82 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.12 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.52 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  34.84 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  31.47 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0160  chemotaxis protein CheD  34.9 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.19 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.91 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.08 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.45 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  30.77 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  27.63 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  27.45 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  35.07 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  27.1 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.85 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.38 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.88 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  30.77 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.21 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  28.12 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0208  chemotaxis protein; stimulates methylation of MCP proteins  34.69 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  27.5 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.29 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.58 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.77 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  33.1 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  30.25 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  36.43 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.33 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  30.13 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.27 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  35.77 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.58 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  32.05 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.8 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  29.49 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.56 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  29.49 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.31 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.7 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.88 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  31.37 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  27.41 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  29.19 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  31.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  27.38 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  29.05 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.29 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.08 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.17 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.98 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.82 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.88 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.82 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>