165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1372 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  86.79 
 
 		 159 aa  270  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  85.53 
 
 		 159 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.52 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  41.83 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  36.36 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  36.77 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.08 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.18 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.54 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.13 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.48 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.27 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.96 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.96 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.18 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.18 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.5 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.82 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.16 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  36.84 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  37.76 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  34.42 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  38.71 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  32.45 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.12 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  36.6 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.84 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.95 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  32.26 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.39 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.18 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  33.54 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  35.03 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.6 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.07 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.19 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.85 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.13 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.54 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.13 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  37.41 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.52 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.82 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.6 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.41 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.06 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.37 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.76 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.56 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.53 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.54 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  31.41 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.71 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  35.26 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.53 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  37.24 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.06 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2713  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.81 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.86 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  31.06 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.54 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  36.64 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  34.87 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.47 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  35.21 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.13 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.58 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  28.19 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.97 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1791  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.09 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  30.92 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.66 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.13 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.22 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.13 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  34.75 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.61 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.41 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  34.4 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.47 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.76 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0620  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.595849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.08 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  28.67 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.58 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>