168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3209 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  75.93 
 
 		 162 aa  260  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.68 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  48.72 
 
 		 171 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.86 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.95 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.23 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  43.95 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  46.5 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.03 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  40.62 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  39.51 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  46.2 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  42.48 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.67 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  40.74 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  41.4 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.98 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.98 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  40.25 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.26 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  39.38 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  39.74 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  40.62 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.21 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.87 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  36.71 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.16 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  37.97 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  39.73 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.58 
 
 		 220 aa  99.8  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.72 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.76 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.67 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.93 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.1 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.24 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.72 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 184 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.77 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.24 
 
 		 184 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.85 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.3 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.1 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.1 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  38 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.44 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  33.97 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  35.57 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  40.14 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0240  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.3 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.24 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.39 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  34.03 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.34 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.79 
 
 		 245 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.57 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.1 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  35.07 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.78 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.25 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  37.11 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.62 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.81 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  32.41 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  37.32 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  35.62 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  27.61 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.06 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  38.69 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.69 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.65 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.08 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  36.15 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.03 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.21 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.38 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.86 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  29.37 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.52 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.78 
 
 		 271 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  33.8 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>