168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1854 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  56.96 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  52.23 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  51.47 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.02 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.02 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.4 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.86 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.86 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.65 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.62 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.59 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  41.61 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.91 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  40.79 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  38.51 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.58 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.84 
 
 		 220 aa  101  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  39.86 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  44.06 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  38.51 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  37.86 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  35.86 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  39.58 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.96 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  36.94 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.07 
 
 		 151 aa  94  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.68 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.51 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.24 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  40.34 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.3 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.38 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.32 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.1 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  35.97 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.62 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  34.87 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  32.54 
 
 		 205 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  39.44 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.97 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  32.45 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  36.96 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  37.21 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.33 
 
 		 245 aa  80.9  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  36.15 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.65 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.41 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  38.94 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.48 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  34.46 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.65 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.77 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.56 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.67 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  34.21 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  31.39 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  27.92 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.56 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.95 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.66 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.35 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  29.87 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.06 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0240  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.3 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  35.11 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.97 
 
 		 253 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.52 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.1 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.52 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  30.67 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.57 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.8 
 
 		 219 aa  70.9  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.13 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.88 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  34.35 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.38 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  31.74 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.45 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.82 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.13 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.13 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.13 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>