168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1147 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  51.25 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.16 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.29 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  41.89 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  39.35 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.51 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.54 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  31.68 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.56 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  31.76 
 
 		 197 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.26 
 
 		 204 aa  88.6  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.91 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.26 
 
 		 245 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  36.24 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 234 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.89 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.76 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.71 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.57 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.97 
 
 		 241 aa  84.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.57 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.36 
 
 		 234 aa  84.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.57 
 
 		 208 aa  84.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.15 
 
 		 212 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.74 
 
 		 157 aa  84.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 247 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 247 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.61 
 
 		 253 aa  84  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.55 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  36.36 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.73 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  31.71 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  37.67 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.75 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.97 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.11 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.82 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.21 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.43 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.42 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.75 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.9 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.05 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0963  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.1 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  33.11 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.05 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.4 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.18 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  31.21 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.79 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.54 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  32.65 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.87 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.17 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  36.99 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.82 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.54 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  35.94 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.82 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.3 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  34.04 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  31.29 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.1 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.21 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.37 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.68 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.39 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  32.87 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.71 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.61 
 
 		 210 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.29 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  31.37 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  34.17 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.84 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.91 
 
 		 227 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  34.23 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  26.88 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  32.64 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  31.54 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.54 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.35 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  27.56 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.99 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  29.87 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>