168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1665 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  54.94 
 
 
162 aa  192  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  55.7 
 
 
161 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  61.01 
 
 
160 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  54.72 
 
 
161 aa  177  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  55.62 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  51.59 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  50.93 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  49.38 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  50 
 
 
160 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  45.62 
 
 
160 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  48.45 
 
 
166 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  48.67 
 
 
157 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  41.1 
 
 
163 aa  144  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.86 
 
 
162 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.87 
 
 
171 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  45.62 
 
 
158 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  46.2 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.95 
 
 
172 aa  136  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.67 
 
 
165 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.37 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.37 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  40.99 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  48 
 
 
173 aa  130  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.24 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.76 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  44.3 
 
 
173 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.77 
 
 
160 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.62 
 
 
154 aa  120  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  46.32 
 
 
145 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.28 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.25 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.28 
 
 
154 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.57 
 
 
151 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.95 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.61 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.34 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  38.46 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.6 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  32.92 
 
 
205 aa  98.2  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  37.58 
 
 
175 aa  97.1  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.67 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  34 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34 
 
 
159 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  36.43 
 
 
169 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  29.86 
 
 
197 aa  90.5  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  31.76 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.07 
 
 
173 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.85 
 
 
204 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.85 
 
 
245 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.77 
 
 
273 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.32 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.51 
 
 
245 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.05 
 
 
206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  32.45 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.07 
 
 
194 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  39.29 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  34.87 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.96 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.87 
 
 
234 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 
206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
253 aa  84.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
234 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 
206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.82 
 
 
198 aa  84  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.04 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.31 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  36.92 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.31 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.43 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.31 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  33.08 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.67 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.77 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  31.47 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  34 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.08 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.88 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.51 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.06 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.31 
 
 
253 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  33.83 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.61 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.03 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.08 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.08 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.61 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.58 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.85 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.39 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.46 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1791  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.09 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>