167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0877 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  42.77 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.21 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.27 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.27 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  42.03 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.54 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.78 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.19 
 
 		 173 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.62 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.4 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  35.71 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.67 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.67 
 
 		 245 aa  87.8  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  33.12 
 
 		 234 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  32.65 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.58 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.1 
 
 		 156 aa  84.7  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.68 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.74 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.22 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.75 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.47 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.33 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.82 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  32.88 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1042  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.24 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.1 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.33 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  32.89 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.97 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  33.97 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.99 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.71 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  30.97 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.5 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  30.72 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.34 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  30.52 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.78 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.08 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.31 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.9 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  33.78 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  32.69 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  30.32 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.26 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.32 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.32 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.61 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  28.32 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.25 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  33.33 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.52 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.52 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.13 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.52 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.48 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  26.67 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.68 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.67 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.15 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.52 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.25 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  31.91 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.65 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.79 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.37 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.39 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.14 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.66 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  27.67 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2845  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.92 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244077  normal  0.188439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.37 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.66 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  29.3 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  29.03 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.05 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>