168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2983 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  100 
 
 		 175 aa  359  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  50.94 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  49.06 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  45.12 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  51.8 
 
 		 131 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  42.77 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.88 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.13 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.53 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.36 
 
 		 206 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.74 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  35.29 
 
 		 234 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.74 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.56 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.3 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.2 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.94 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  30 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.03 
 
 		 154 aa  87.8  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.45 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  28.83 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  31.68 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.83 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.47 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.13 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.13 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.93 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.9 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1042  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.9 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.52 
 
 		 206 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.9 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.55 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.67 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  33.55 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  30.43 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.37 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  32.05 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.9 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  31.82 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  31.82 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.1 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.376029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.34 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  33.13 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  30.97 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.33 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.22 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  29.01 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.33 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.14 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.4 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  25.32 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.85 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  31.58 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.71 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.83 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.92 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.52 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  30.26 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0726  chemotaxis protein CheD, putative  29.38 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.345445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  31.54 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  29.41 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  32.68 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.33 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.19 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2845  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.03 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244077  normal  0.188439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.68 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.46 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.48 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.66 
 
 		 273 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  29.33 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  24.22 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  29.93 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  31.17 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.19 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.45 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.9 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0963  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.95 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.68 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.8 
 
 		 227 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.1 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  32.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  29.68 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.07 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  26.43 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.37 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  26.09 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.56 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  27.03 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  27.33 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>