168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4129 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  54.04 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  48.45 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  47.83 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.91 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.62 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  49.68 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  47.8 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  47.4 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  46.58 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  44.72 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  47.74 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  44.94 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.44 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.44 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  44.65 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  45.57 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  45.22 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  42.68 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  42.04 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.4 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  50.37 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.18 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.57 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.87 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  39.87 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.86 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.41 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  38.99 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.33 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.86 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  41.56 
 
 		 205 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.54 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.5 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.51 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.19 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.86 
 
 		 206 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.73 
 
 		 206 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.73 
 
 		 206 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.68 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.67 
 
 		 206 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.84 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.1 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.68 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  39.42 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.09 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.5 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.3 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.3 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  33.96 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.34 
 
 		 184 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.34 
 
 		 184 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.18 
 
 		 198 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  35.44 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.41 
 
 		 242 aa  87.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.69 
 
 		 241 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.78 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.04 
 
 		 184 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.41 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.25 
 
 		 245 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.97 
 
 		 273 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  34.78 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  40.77 
 
 		 197 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00414  CheD  33.57 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.999613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 234 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.64 
 
 		 204 aa  84.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.23 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.64 
 
 		 245 aa  84.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  33.09 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.96 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.69 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.5 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.85 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.08 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.25 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.81 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3472  CheD  33.87 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.54 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  36.5 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.01 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  31.85 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  34.04 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.45 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  35.34 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.94 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  36.15 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>