129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl332 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl332  transcription termination factor  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254832  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0058  N utilization substance protein B (nusB), putative  54.96 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  35.29 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  35.48 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  32.26 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  29.6 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  31.53 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  35.37 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  50 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  34.15 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  29 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  27.07 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  35.25 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  26.61 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf181  transcription termination factor  36.51 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.227846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  32.53 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  26.72 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  29.41 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  31.5 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  27.78 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  29.92 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  32.93 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  33.8 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  29.92 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  32.94 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  33.82 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  29.8 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  29.69 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  35.59 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  29.41 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  37.84 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  32.5 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  24.81 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  26.98 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  25.93 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  35.53 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  32.39 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  35.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  37.31 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2192  NusB antitermination factor  30.95 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133717  hitchhiker  0.00000478528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  25 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  33.8 
 
 		 235 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  44.9 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  33.8 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  26.56 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  40 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0297  transcription antitermination factor NusB  28.23 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3919  transcription antitermination protein NusB  27.69 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  29.58 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  31 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7540  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  25.93 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  31.46 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  32.5 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1654  N utilization substance protein B  44.9 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00612472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  33.73 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  30.99 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  28.92 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  29.41 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0012  NusB antitermination factor  31.45 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  27.91 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  28.15 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  27.91 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  27.07 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  34 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  33.9 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.71 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  29.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>