More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1032 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  100 
 
 
127 aa  246  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  38.81 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  40.91 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  39.55 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  40.24 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  34.65 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  34.33 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  29.46 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  31.82 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  31.03 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  38.97 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  32.28 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  43.9 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  38.75 
 
 
208 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  41.25 
 
 
205 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  33.6 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  32.8 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 
211 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  41.18 
 
 
235 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.23 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  34.75 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  41.25 
 
 
208 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.46 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  30.95 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  31.71 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  31.71 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  35.37 
 
 
213 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  30 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  30.95 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  31.01 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  31.25 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4056  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2949  putative N utilization substance B (transcriptional antiterminator)(l factor) transcription regulator protein  30.08 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0215714  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2937  NusB antitermination factor  34.21 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  27.27 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  30.16 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  37.35 
 
 
211 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  42.86 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0825  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.61519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  29.84 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  29.84 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  35.19 
 
 
207 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0816  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  29.84 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  23.19 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  33.71 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0012  NusB antitermination factor  32.2 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  31.58 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0917  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0476  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  32.54 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0955  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  32.48 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  32.56 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  37.35 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0493  NusB antitermination factor  30.47 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.298968  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0891  transcription antitermination protein NusB  31.15 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2919  transcription antitermination protein NusB  27.05 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  31.93 
 
 
213 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  32.33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  38.38 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  24.65 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2442  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4793  NusB antitermination factor  21.54 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00602404  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3103  transcription antitermination protein NusB  31.15 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  32 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0617  transcription antitermination protein NusB  31.97 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>