95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0297 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0297  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  31.4 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  30.33 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  30.33 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  35.59 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  29.35 
 
 		 325 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3919  transcription antitermination protein NusB  29.1 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  23.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  36.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  33.9 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  32.2 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  30 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  34.18 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2695  transcription antitermination protein NusB  28.33 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.32403  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  26.15 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4056  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  32.14 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  23.3 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  25.22 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl332  transcription termination factor  28.23 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  32.91 
 
 		 309 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  25.88 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  25.4 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2018  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.415369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2147  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0762  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  31.87 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1529  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0768  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2595  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3071  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3018  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  26.98 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2442  transcription antitermination protein NusB  25.42 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0816  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0825  transcription antitermination protein NusB  27.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.61519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  30.77 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  26.28 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0896  NusB antitermination factor  24.63 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.361769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  20.49 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0476  transcription antitermination protein NusB  26.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0955  transcription antitermination protein NusB  26.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0891  transcription antitermination protein NusB  27.97 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0917  transcription antitermination protein NusB  26.27 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  34.43 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  27.07 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1844  transcription antitermination protein NusB  25.32 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0290  NusB antitermination factor  25.6 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  32.14 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  26.56 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1904  transcription antitermination protein NusB  25.32 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  31.17 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  27.85 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  25.44 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  25.78 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  25.44 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  28.03 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  25.44 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  22.05 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0058  N utilization substance protein B (nusB), putative  32.39 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0639  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0264  NusB antitermination factor  24 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  22.11 
 
 		 142 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  22.11 
 
 		 142 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  32.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3103  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  29.51 
 
 		 207 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  22.11 
 
 		 142 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0704  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0660  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  25 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  23.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  27.85 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3112  NusB antitermination factor  24.68 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.42973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  25.81 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  32.88 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  24.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  29.41 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0711  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.872315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  26.51 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  26.19 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  27.42 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  32.39 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3739  NusB antitermination factor  24.24 
 
 		 163 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>