284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0639 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0639  NusB antitermination factor  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  32.06 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1286  NusB antitermination factor  30.92 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  30.2 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  25.95 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  32.06 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  25.95 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  27.27 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  30.59 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  30.59 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  30.59 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  25.19 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  26.12 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  24.8 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  29.55 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  25.38 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  29.41 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  31.31 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  29.71 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  30.59 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  30 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  25 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  25.9 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  25.37 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  31.01 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  30.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  29.46 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  24.82 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  31.29 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  25.37 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  26.32 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  26.12 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  26.15 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  32.06 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  27.46 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  30.23 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  24.06 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  23.85 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.63 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  26.56 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  27.01 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  27.01 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  29.13 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  24.32 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  28.46 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  30.08 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  27.01 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  27.46 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  28.47 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  26.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  31.69 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  23.65 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  28.47 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  29.77 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  31.06 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  31.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  31.97 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  27.82 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  23.7 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  30.23 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  27.91 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  25.76 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  28.91 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  31.15 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  27.69 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  25.51 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  24.62 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  28.35 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>