More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0416 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0416  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 326 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  35.28 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.6 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.08 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.37 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.65 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  34.9 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.23 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.11 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.41 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  33.85 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.53 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.21 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.11 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.31 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.14 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  34.46 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  33.76 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.65 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  34.66 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  33.67 
 
 		 329 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  32.92 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.87 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  33.43 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.87 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  34.41 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  34.3 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.98 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.31 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  30.48 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.71 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  31.19 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  33.56 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  33 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  32.8 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  37.04 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.48 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.3 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.23 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  33.22 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  29.1 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  34.21 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.47 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  31.72 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  30.57 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.01 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  32.21 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.01 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  34.68 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  34.97 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.42 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  33.01 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  32.18 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.8 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  32.61 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.97 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  34.46 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  31.82 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  33.9 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  34.11 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  33.56 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.97 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  32.65 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  34.88 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  33.55 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  34.44 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  34.56 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  32.64 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.46 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  31.86 
 
 		 698 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  34.23 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.32 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  30.89 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.16 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  32.3 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  32.19 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  31.75 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  31.99 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  33.66 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  31.68 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.55 
 
 		 684 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>