More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5452 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.56 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.05 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.05 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  44.7 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.19 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.46 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.09 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.39 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.3 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.52 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.76 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.72 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.45 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  39.38 
 
 		 322 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.51 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.39 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.67 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  42.19 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  40.65 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.94 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.46 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  38.58 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  41 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  40.47 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.81 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  41.25 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.53 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.06 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.46 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  40.31 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.13 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.69 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.07 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.81 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.6 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  41.2 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.65 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.32 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.47 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.85 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  40.12 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.8 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.08 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  39.26 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.66 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.46 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.06 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.8 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  40.92 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  38.7 
 
 		 332 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.73 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.47 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  37.22 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  36.84 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.14 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.07 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  40.37 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.38 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  41.28 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.85 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.54 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.92 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.64 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.27 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.8 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.05 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  34.47 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.83 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.38 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  41.45 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.29 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.17 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.06 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  41.72 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.49 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.61 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 335 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.54 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.37 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.38 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>