More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2443 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2443  ABC transporter related protein  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2377  ABC transporter-like protein  86.21 
 
 
261 aa  454  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  45.95 
 
 
266 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  45.59 
 
 
263 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  45.42 
 
 
272 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  46.21 
 
 
276 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  44.44 
 
 
266 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  45.04 
 
 
272 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  46.79 
 
 
279 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  43.94 
 
 
265 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  45.77 
 
 
279 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  45.38 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
272 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  43.85 
 
 
273 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  43.85 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  46.79 
 
 
280 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  43.68 
 
 
299 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  43.3 
 
 
283 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  46.42 
 
 
279 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  44.27 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  45.42 
 
 
272 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  42.42 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  43.35 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  41.6 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  40.46 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  42.05 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.75 
 
 
276 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  42.75 
 
 
276 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  41.98 
 
 
276 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  43.73 
 
 
278 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  44.74 
 
 
279 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  41.98 
 
 
267 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  40.61 
 
 
269 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  40.61 
 
 
269 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  39.92 
 
 
269 aa  205  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  43.89 
 
 
281 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  42.26 
 
 
274 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
270 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  40.23 
 
 
269 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.96 
 
 
257 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  45.23 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  40.84 
 
 
274 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  40.22 
 
 
271 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  39.85 
 
 
269 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  40.46 
 
 
270 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  40.22 
 
 
271 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  40.84 
 
 
276 aa  201  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
267 aa  201  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  40.53 
 
 
263 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.15 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  39.08 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.03 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  44.31 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  42.8 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  44.67 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
247 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  43.44 
 
 
247 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.59 
 
 
234 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  44.03 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  43.67 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  42.44 
 
 
233 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  43.75 
 
 
235 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  43.75 
 
 
235 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.58 
 
 
235 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  40.37 
 
 
258 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  44.67 
 
 
237 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.74 
 
 
236 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  42.02 
 
 
233 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  45.04 
 
 
247 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  41.22 
 
 
264 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
235 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
247 aa  184  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.39 
 
 
236 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  44.81 
 
 
823 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  45 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  44.81 
 
 
823 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  44.35 
 
 
241 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.98 
 
 
249 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  41.91 
 
 
234 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.68 
 
 
239 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  45.02 
 
 
234 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  44.26 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  45.68 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.26 
 
 
235 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  40.33 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  43.8 
 
 
236 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
237 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
234 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  46.33 
 
 
827 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  42.15 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>