More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2299 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2299  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  38.03 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.57 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  38.97 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  38.68 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.81 
 
 		 237 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  36.68 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.3 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.19 
 
 		 234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  40.1 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.14 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  37.25 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.06 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  37.37 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  37.19 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.86 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  35.1 
 
 		 234 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.73 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  33.2 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.32 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.35 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.35 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.5 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  34.74 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  34.74 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.71 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  36.04 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  36 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.5 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  35.32 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  34.95 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  42.33 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  33.64 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  34.6 
 
 		 248 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  37.33 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  35.35 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.66 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.64 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09440  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  35.32 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000968769  normal  0.0803306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0789  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00354357  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  35.9 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  35.9 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  35.9 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.9 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  35.9 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  37.38 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  36.18 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  37.25 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  34.5 
 
 		 276 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  36.87 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  35.64 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  32.52 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  33.49 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  33.79 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  34.87 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.87 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  33.66 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  35.12 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  34.09 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  35.32 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  34.1 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  36.97 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.86 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  35 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  34.98 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.87 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  34.52 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  32.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  34.87 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  33.81 
 
 		 222 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  34.88 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  35.05 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  34.36 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3523  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.758278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  32.42 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  35.78 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  34.36 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  32.5 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  31.34 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  37 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  35.03 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  33.95 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  33.95 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  37.25 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  41.56 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  33.84 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>