More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0789 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0789  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00354357  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  34.21 
 
 
227 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 
229 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36.12 
 
 
229 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  34.53 
 
 
234 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  33.48 
 
 
244 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.43 
 
 
237 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.14 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  36.14 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  33.03 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  32.74 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  34.67 
 
 
229 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  33.88 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  31.28 
 
 
227 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2299  hypothetical protein  44.16 
 
 
214 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  32.91 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  32.91 
 
 
235 aa  111  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  31.94 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.82 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  34.24 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  31.36 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  34.78 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  31.72 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  33.02 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  35.9 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  35.14 
 
 
240 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  35.29 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  31.28 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  33.04 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  34.22 
 
 
231 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  34.53 
 
 
229 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  31.66 
 
 
235 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  34.16 
 
 
224 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  34.16 
 
 
224 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1699  alanine racemase domain protein  32.22 
 
 
253 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.021514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0159  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
231 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00156899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  34.16 
 
 
224 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.16 
 
 
224 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  40.4 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  32.87 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.78 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  34.78 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  38.2 
 
 
190 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  31.63 
 
 
226 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 
222 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.81 
 
 
216 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.75 
 
 
230 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 
222 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  41.01 
 
 
212 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.93 
 
 
234 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0088  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.03 
 
 
266 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  30.47 
 
 
228 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  32.3 
 
 
219 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  29.09 
 
 
275 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.16 
 
 
224 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  35.75 
 
 
199 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  37.64 
 
 
211 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  30.32 
 
 
224 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  34.76 
 
 
228 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 
230 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  31.48 
 
 
212 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  30.04 
 
 
246 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  33.54 
 
 
224 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 
220 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 
230 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  32.77 
 
 
235 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  33.54 
 
 
222 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  34.03 
 
 
242 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  30.32 
 
 
219 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  35.33 
 
 
240 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  33.7 
 
 
225 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  37.25 
 
 
271 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  32.03 
 
 
228 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.33 
 
 
231 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  35.37 
 
 
220 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  32.9 
 
 
223 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  33.64 
 
 
235 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  36.55 
 
 
220 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  32.97 
 
 
241 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  35.91 
 
 
231 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  37.85 
 
 
211 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  30.99 
 
 
248 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  33.55 
 
 
232 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
244 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  33.01 
 
 
213 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  32.32 
 
 
233 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  29.86 
 
 
255 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  36.91 
 
 
226 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  34.59 
 
 
219 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  30.63 
 
 
225 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  34.59 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  29.57 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  30.13 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  28 
 
 
228 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  33.11 
 
 
224 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  29.28 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.66 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>