More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02127 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  48.65 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  63.49 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  51.56 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.56 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  54.84 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  44.87 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  53.23 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  51.61 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  51.61 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  51.61 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  55.17 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  46.77 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  51.61 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  53.23 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  53.23 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  50 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  48.44 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  45.95 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  40.28 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  46.27 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  48.57 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  43.06 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  41.77 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  45.95 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  49.18 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  46.27 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  48.21 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  50 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.91 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  44.62 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  36.9 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.37 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  45.61 
 
 		 711 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  48.28 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  43.28 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  48.28 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  38.89 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.79 
 
 		 687 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.45 
 
 		 690 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  43.28 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  41.67 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  45.59 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  43.48 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  44.12 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  43.48 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  43.48 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  43.48 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  43.48 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.33 
 
 		 686 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  36.05 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  40 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.67 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  42.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  31.87 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.67 
 
 		 677 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  37.21 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.86 
 
 		 687 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  31.46 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  52.08 
 
 		 351 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.98 
 
 		 675 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 691 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  29.67 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  35.82 
 
 		 678 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  29.67 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  57.89 
 
 		 670 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.29 
 
 		 678 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  29.67 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  55.26 
 
 		 597 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.77 
 
 		 316 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>