189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1579 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  100 
 
 		 85 aa  180  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  71.08 
 
 		 88 aa  130  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  69.88 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  48.15 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  45.45 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  46.91 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.56 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  42.31 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  43.28 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.16 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.12 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.12 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.12 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.03 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.12 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.19 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  40.79 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  40.3 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  39.51 
 
 		 339 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  43.86 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  39.06 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.62 
 
 		 342 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  35.21 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  36.51 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  36.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  40.91 
 
 		 340 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  36.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2107  flavodoxin reductase (ferredoxin-NADPH reductase) family protein 1-like protein  33.33 
 
 		 336 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  36.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.94 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  36.62 
 
 		 369 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.34 
 
 		 354 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.34 
 
 		 354 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  40.35 
 
 		 711 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.34 
 
 		 354 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.5 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.99 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 		 336 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.14 
 
 		 354 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.62 
 
 		 345 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  39.29 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  51.43 
 
 		 365 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  31.65 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.34 
 
 		 338 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  38.24 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  34.18 
 
 		 340 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.84 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  39.39 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  34.92 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  41.1 
 
 		 367 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.38 
 
 		 331 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  34.92 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  34.38 
 
 		 385 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.29 
 
 		 389 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1832  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.29 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  32.76 
 
 		 676 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.18 
 
 		 675 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  34.92 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  34.92 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  38.46 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 		 676 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  34.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  37.5 
 
 		 369 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  34.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  34.92 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  38.98 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  35.29 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  34.92 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  48.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  34.92 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  48.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  40 
 
 		 366 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  48.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.72 
 
 		 348 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>