More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0873 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 92 aa  190  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  73.91 
 
 		 92 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  72.53 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  52.81 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  44.87 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  43.28 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.28 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.28 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.62 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  46.03 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  45.59 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  46.03 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.48 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  43.66 
 
 		 371 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.65 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  38.03 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  41.18 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.85 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.76 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.71 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  48.08 
 
 		 711 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.24 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.33 
 
 		 585 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  41.94 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.18 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  42.03 
 
 		 674 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  40.3 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  40.85 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  40.85 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  40.85 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  40.85 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  36.62 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  40.85 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  41.18 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  39.71 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.59 
 
 		 678 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  38.67 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  42.59 
 
 		 678 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.59 
 
 		 678 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  35.53 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  40.91 
 
 		 367 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  32.89 
 
 		 366 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  38.1 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.71 
 
 		 330 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0219052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  35.82 
 
 		 351 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.23 
 
 		 675 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.07 
 
 		 687 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  38.1 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 		 687 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  31.65 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  36.23 
 
 		 318 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  36.36 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  38.1 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  36.05 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  38.1 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  36.05 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09840  ferredoxin  31.51 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  42.37 
 
 		 586 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  34.25 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  36.51 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  52.63 
 
 		 681 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  34.78 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  35.71 
 
 		 317 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  31.82 
 
 		 1070 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  32.84 
 
 		 318 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  42.31 
 
 		 676 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.88 
 
 		 700 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  35.62 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.03 
 
 		 686 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  31.82 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  37.7 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.46 
 
 		 676 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>