More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3181 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  100 
 
 		 318 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  53.92 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  48.43 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  50.63 
 
 		 316 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.79 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  45.34 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.03 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  43.48 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  45.45 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  44.72 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  46.5 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  42.72 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  42.72 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  42.72 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.03 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  42.41 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  42.11 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  42.11 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  43.12 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  38.94 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  39.37 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  38.63 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  37.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  38.04 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  37.15 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  40.56 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  36.68 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  36.25 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  35.62 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  37.34 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  38.08 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.22 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.22 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.3 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  36.99 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  35.37 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  35.37 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  41.43 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  38.27 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  36.88 
 
 		 588 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.45 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  38.44 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.74 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  33.96 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  39.4 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  38.1 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  36.81 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  37.07 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.42 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  36.48 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.22 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  35.08 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  36.16 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.55 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.68 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  35.19 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  36.84 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.57 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.86 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.37 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.17 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.74 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.54 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  36.28 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  36.81 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7253  ferredoxin  34.57 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  37.62 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  35.42 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  35.26 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  36.39 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  35.8 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  35.4 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  33.96 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  35.4 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  36.42 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.16 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  35.15 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  37.74 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  36.45 
 
 		 784 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  36.42 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  34.98 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  35.49 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  32.91 
 
 		 788 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  35.49 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  38.18 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  35.29 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.19 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  36.91 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.09 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  33.45 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.74 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  35.49 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  36.39 
 
 		 351 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  37.65 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  33.02 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  35.11 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  35.26 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.15 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>