More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1371 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
325 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  41.64 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  42.46 
 
 
309 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.63 
 
 
330 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  39.09 
 
 
328 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  38.8 
 
 
317 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.87 
 
 
319 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.38 
 
 
316 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.53 
 
 
317 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.11 
 
 
334 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  38.89 
 
 
319 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.77 
 
 
321 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  36.73 
 
 
784 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  36.83 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.53 
 
 
317 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  36.02 
 
 
321 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  36.84 
 
 
329 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  34.83 
 
 
558 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  38.34 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.42 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  36.59 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.62 
 
 
318 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  37.88 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.75 
 
 
775 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  35.47 
 
 
316 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  35.47 
 
 
316 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  37.62 
 
 
321 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  36.34 
 
 
321 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.34 
 
 
321 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.34 
 
 
321 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  37.23 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.04 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  37.18 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  38.02 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  37.05 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  37.42 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  34.82 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  37.12 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  36.81 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.12 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.12 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.14 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  37.12 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  37.12 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  36 
 
 
323 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  35.91 
 
 
320 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  36.65 
 
 
782 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  36.81 
 
 
320 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  37.46 
 
 
325 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  36.06 
 
 
316 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  36.81 
 
 
320 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.12 
 
 
321 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.5 
 
 
321 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.65 
 
 
317 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  35.57 
 
 
588 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  35.65 
 
 
323 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  36.73 
 
 
321 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  34.34 
 
 
332 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  37.07 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  36.47 
 
 
318 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  35.39 
 
 
320 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  35.49 
 
 
326 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  38.19 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  37.58 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  36.89 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  36.78 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.45 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  35.92 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.58 
 
 
330 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  36.88 
 
 
318 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  32.42 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37 
 
 
783 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  32.84 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  36.47 
 
 
321 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.36 
 
 
319 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.67 
 
 
322 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  36.75 
 
 
780 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  37.58 
 
 
794 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  34.45 
 
 
334 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.54 
 
 
324 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  35.6 
 
 
788 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  34.43 
 
 
788 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  33.33 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  34.23 
 
 
321 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  36.57 
 
 
322 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  35.09 
 
 
318 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  34.43 
 
 
333 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  36.45 
 
 
784 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  34.43 
 
 
333 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  38.94 
 
 
368 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  38.94 
 
 
368 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  36.65 
 
 
324 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7253  ferredoxin  34.05 
 
 
334 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  38.94 
 
 
368 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  36.14 
 
 
784 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>