More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6582 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  100 
 
 		 321 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  92.21 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  83.8 
 
 		 321 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  50.16 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  45.34 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  42.06 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.41 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  41.54 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  41.23 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.23 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  40.92 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  40.92 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  43.26 
 
 		 316 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.27 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  41.51 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  41.64 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  41.3 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  39.43 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  38.77 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  38.08 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  38.04 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.12 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  38.53 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  37.92 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  38.11 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  37.92 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  37.92 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  38.93 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  38.53 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.99 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  36.99 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.44 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  39.93 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.56 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.69 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  36.84 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.75 
 
 		 782 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  38.24 
 
 		 784 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.08 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.31 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.31 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  38.41 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  36.14 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  36.59 
 
 		 788 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  35.21 
 
 		 558 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.32 
 
 		 783 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.56 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  37.58 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  37.05 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  36.25 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  37.46 
 
 		 780 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  36.59 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  39.56 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  36.99 
 
 		 783 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  36.68 
 
 		 784 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  36.68 
 
 		 784 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  36.68 
 
 		 784 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  36.68 
 
 		 784 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  36.36 
 
 		 784 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  36.36 
 
 		 784 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  38.39 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  36.25 
 
 		 788 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  36.05 
 
 		 784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  36.11 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  38.61 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  35.62 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  36.45 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.62 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.47 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  33.94 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  35.62 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.59 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  34.16 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.38 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  35 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  35.94 
 
 		 775 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  37.38 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.78 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.89 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.91 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2623  ferredoxin  37 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3958  ferredoxin  35.09 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  37.22 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  35.87 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  34.06 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  35.47 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  35.67 
 
 		 794 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  34.98 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.13 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  34.06 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  33.23 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  33.85 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  33.44 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  33.44 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  33.33 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  31.58 
 
 		 1070 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>