More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5925 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  100 
 
 
315 aa  627  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  60.84 
 
 
309 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  47.21 
 
 
784 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  46.89 
 
 
784 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  46.25 
 
 
783 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  43.67 
 
 
784 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39.81 
 
 
788 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  38.82 
 
 
322 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  39.06 
 
 
322 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  46.08 
 
 
769 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  44.82 
 
 
794 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  41.75 
 
 
780 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.3 
 
 
320 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  41.46 
 
 
321 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.93 
 
 
783 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.94 
 
 
322 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.87 
 
 
321 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  40.19 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  40.19 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  40.66 
 
 
309 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.39 
 
 
321 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  39.56 
 
 
321 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.13 
 
 
319 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.56 
 
 
323 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  44.24 
 
 
775 aa  205  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  40.62 
 
 
337 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  40.76 
 
 
782 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.87 
 
 
321 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  40.82 
 
 
788 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  40.97 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  39.29 
 
 
1069 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  40.36 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  40.36 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  40 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  37.46 
 
 
320 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  37.46 
 
 
320 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  43 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  39.88 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  39.88 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  36.39 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.75 
 
 
316 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  35.69 
 
 
323 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.25 
 
 
319 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.42 
 
 
317 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.99 
 
 
315 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  38.36 
 
 
351 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  38.19 
 
 
317 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.29 
 
 
319 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.7 
 
 
316 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  38.89 
 
 
1070 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.63 
 
 
318 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  38.87 
 
 
317 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  37.11 
 
 
320 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  42.14 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.38 
 
 
316 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  37.54 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  36.59 
 
 
320 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  38.46 
 
 
323 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  38.75 
 
 
322 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.67 
 
 
588 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.07 
 
 
317 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.08 
 
 
331 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  40.55 
 
 
323 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  37.3 
 
 
318 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  42.99 
 
 
365 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  36.79 
 
 
315 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.72 
 
 
317 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  35 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  40.24 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  37.99 
 
 
317 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.22 
 
 
334 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  34.58 
 
 
320 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  41.69 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  40.72 
 
 
328 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  39.8 
 
 
330 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.66 
 
 
315 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.63 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  37.93 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  38.22 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  41.22 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  41.69 
 
 
774 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  38.14 
 
 
326 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  38.56 
 
 
385 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  35.94 
 
 
321 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  37.93 
 
 
320 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  39.86 
 
 
326 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  38.83 
 
 
316 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  40 
 
 
325 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.08 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  38.87 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  39.87 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  40.54 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  41.72 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  39 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  32.23 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>