More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0545 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  49.28 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  36.71 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  36.71 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  40.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  40.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  40.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  40.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.03 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  40.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  43.28 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  44.78 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  37.88 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  37.88 
 
 		 367 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  35.63 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  36.92 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  37.88 
 
 		 369 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.06 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  35.06 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  37.8 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.65 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  37.97 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  40.91 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  37.5 
 
 		 486 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  42.86 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  35 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.67 
 
 		 585 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  35.37 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  36.36 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  34.15 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  41.94 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  35.37 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  46.67 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.31 
 
 		 344 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  37.97 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.18 
 
 		 341 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  37.97 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.37 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.37 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.03 
 
 		 342 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.82 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.62 
 
 		 362 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.71 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.24 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.24 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.78 
 
 		 340 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09840  ferredoxin  46.15 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.71 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  38.89 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  36.76 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  40.79 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.68 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.5 
 
 		 341 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.75 
 
 		 358 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  45.9 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  43.64 
 
 		 318 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  45.9 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 		 364 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 		 364 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.46 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  35.38 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.57 
 
 		 339 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  35.48 
 
 		 711 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.59 
 
 		 330 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0219052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  37.88 
 
 		 367 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 		 329 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  38.89 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 		 329 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 268 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.59 
 
 		 364 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.88 
 
 		 397 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  63.64 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  45.9 
 
 		 350 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  40.32 
 
 		 358 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.92 
 
 		 1138 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 		 329 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  32.93 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  31.71 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0899  hypothetical protein  63.64 
 
 		 306 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  32.56 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  32.56 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  36.23 
 
 		 605 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  36.25 
 
 		 605 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  37.5 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  37.5 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>